علم الأحياء / التسلسلات
أدوات تسلسل DNA (المتمم العكسي، محتوى GC، الترجمة)
الصق تسلسل DNA أو RNA، نصيًا أو بتنسيق FASTA، واحصل على طوله، وعدد القواعد، ومحتوى GC، والمتمم العكسي، والمتمم، والترجمة ضمن أطر القراءة الستة، وأطول إطار قراءة مفتوح.
أدوات تسلسل DNA (المتمم العكسي، محتوى GC، الترجمة): يقرأ المتمم العكسي السلسلة الأخرى من 5′ إلى 3′: اعكس التسلسل واستبدل A↔T وC↔G، مع إكمال رموز الغموض أيضًا. تقرأ الترجمة الكودونات باستخدام الشفرة الجينية القياسية، ضمن أطر تبدأ من القاعدة الأولى أو الثانية أو الثالثة لكل سلسلة؛ وتشير * إلى كودون توقف. يمتد أطول إطار قراءة مفتوح من ATG إلى كودون التوقف التالي. تتطابق النتائج مع Biopython. يعمل 100% محليًا في المتصفح، من دون رفع أي ملفات إلى الخادم.
- مرات التشغيل
- في المتصفح
- التكلفة
- مجاني · بلا تسجيل
- التوفر
- جاهز للاستخدام
تعمل بالكامل في المتصفح
المتمم العكسي
CTATCGGGCACCCTTTCAGCGGCCCATTACAATGGCCAT
المتمم
TACCGGTAACATTACCCGGCGACTTTCCCACGGGCTATC
الترجمة في ستة إطارات
+1 MAIVMGR*KGAR* +2 WPL*WAAERVPD +3 GHCNGPLKGCPI −1 LSGTLSAAHYNGH −2 YRAPFQRPITMA −3 IGHPFSGPLQWP
بروتين أطول ORF
MAIVMGR
ألصق تسلسلًا بنص عادي أو بتنسيق FASTA؛ تُقرأ U على أنها T، وتُزال أي محارف ليست أحرف قواعد. تستخدم الترجمة الشفرة الجينية القياسية، مع * للكودونات المتوقفة وX للكودونات التي تحتوي على قواعد غير محددة. تقرأ الإطارات من +1 إلى +3 السلسلة كما هي بدءًا من القاعدة الأولى أو الثانية أو الثالثة؛ وتقرأ الإطارات من −1 إلى −3 المتمم العكسي. يمتد أطول ORF من ATG إلى كودون التوقف التالي أو إلى نهاية التسلسل.
مثال محلول
يتكون ATGGCCATTGTAATGGGCCGCTGAAAGGGTGCCCGATAG من 39 bp وتبلغ نسبة GC فيه 56.4%. يقرأ الإطار +1 التسلسل MAIVMGR*KGAR*، لذا يرمّز إطار القراءة المفتوح بدءًا من أول ATG للأحماض الأمينية السبعة MAIVMGR قبل كودون التوقف TGA.
لتصميم البوادئ على التسلسل، تحقّق من درجة انصهارها باستخدام حاسبة Tm للبادئ.
محتوى GC
تحتوي أزواج GC على ثلاث روابط هيدروجينية، بينما يحتوي زوجا A–T على رابطتين، لذلك ينصهر DNA الغني بـ GC عند درجات حرارة أعلى. تتراوح الجينومات من أقل من 20% GC لدى بعض الطفيليات إلى أكثر من 70% لدى بعض البكتيريا؛ ويبلغ متوسط DNA البشري نحو 41%.
لدراسة التوارث على مستوى الجينات الكاملة، استخدم حاسبة مربع بونيت.
طريقة الاستخدام
- الصق التسلسل؛ ستُزال عناوين FASTA والأرقام والمسافات.
- اقرأ الطول، وعدد القواعد، ومحتوى GC.
- انسخ المتمم العكسي أو إحدى نتائج الترجمة.
الخصوصية والقيود
تبقى تسلسلاتك في المتصفح؛ ولا يتم رفع أي شيء.
أدوات ذات صلة
الأسئلة الشائعة
لماذا نستخدم المتمم العكسي؟
تسير سلسلتا DNA في اتجاهين متعاكسين، لذلك يكون تسلسل السلسلة الأخرى، عند قراءته بالطريقة المعتادة، هو المتمم العكسي؛ وتُكتب بادئات السلسلة العكسية بهذه الطريقة.
هل يدعم الأداة RNA؟
نعم: تُقرأ U باعتبارها T، لذلك تُعرض النتائج باستخدام أحرف DNA.
ما الشفرة الجينية المستخدمة؟
تُستخدم الشفرة القياسية (جدول NCBI 1)؛ إذ تستخدم جينات الميتوكوندريا وبعض الكائنات الميكروبية شفرات مختلفة قليلًا.
أداة مجانية · عدد مرات الاستخدام في المتصفح · لا يتطلب حسابًا