Biología / Secuencias
Herramientas para secuencias de ADN (complemento inverso, contenido de GC y traducción)
Pega una secuencia de ADN o ARN, en texto plano o FASTA, y obtén su longitud, el recuento de bases, el contenido de GC, el complemento inverso, el complemento, la traducción en los seis marcos de lectura y el marco de lectura abierto más largo.
Herramientas para secuencias de ADN (complemento inverso, contenido de GC y traducción): El complemento inverso lee la otra hebra de 5′ a 3′: invierte la secuencia y cambia A↔T y C↔G; los códigos de ambigüedad también se complementan. La traducción lee los codones con el código genético estándar, en marcos que comienzan en la primera, segunda y tercera base de cada hebra; * indica un codón de terminación. El marco de lectura abierto más largo va desde un ATG hasta el siguiente codón de terminación. Los resultados coinciden con Biopython. Funciona al 100 % en tu navegador, sin subir archivos a ningún servidor.
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Complemento inverso
CTATCGGGCACCCTTTCAGCGGCCCATTACAATGGCCAT
Complemento
TACCGGTAACATTACCCGGCGACTTTCCCACGGGCTATC
Traducción en seis marcos
+1 MAIVMGR*KGAR* +2 WPL*WAAERVPD +3 GHCNGPLKGCPI −1 LSGTLSAAHYNGH −2 YRAPFQRPITMA −3 IGHPFSGPLQWP
Proteína del ORF más largo
MAIVMGR
Pega una secuencia en texto sin formato o en formato FASTA; U se interpreta como T y se elimina todo lo que no sea una letra de base. La traducción usa el código genético estándar, con * para los codones de terminación y X para los codones que contienen bases ambiguas. Los marcos +1 a +3 leen la cadena indicada desde la primera, segunda y tercera base; −1 a −3 leen el complemento inverso. El ORF más largo va desde un ATG hasta el siguiente codón de terminación o hasta el final de la secuencia.
Ejemplo resuelto
ATGGCCATTGTAATGGGCCGCTGAAAGGGTGCCCGATAG tiene 39 bp y un 56,4% de GC. El marco +1 se lee MAIVMGR*KGAR*, por lo que el marco de lectura abierto desde el primer ATG codifica los 7 aminoácidos MAIVMGR antes del codón de terminación TGA.
Para diseñar cebadores en la secuencia, comprueba su temperatura de fusión con la calculadora de Tm de cebadores.
Contenido de GC
Los pares GC tienen tres enlaces de hidrógeno y los pares A–T tienen dos, por lo que el ADN rico en GC se funde a temperaturas más altas. Los genomas van desde menos del 20% de GC en algunos parásitos hasta más del 70% en algunas bacterias; el ADN humano tiene un promedio de aproximadamente 41%.
Para estudiar la herencia al nivel de genes completos, usa la calculadora del cuadro de Punnett.
Cómo se usa
- Pega la secuencia; se eliminan las cabeceras FASTA, los números y los espacios.
- Consulta la longitud, el recuento de bases y el contenido de GC.
- Copia el complemento inverso o una traducción.
Privacidad y límites
Tus secuencias permanecen en tu navegador; no se sube nada.
Herramientas relacionadas
Preguntas frecuentes
¿Por qué usar el complemento inverso?
Las hebras de ADN avanzan en direcciones opuestas, por lo que la secuencia de la otra hebra, leída de la forma habitual, es el complemento inverso; los cebadores de la hebra inversa se escriben así.
¿Se admite el ARN?
Sí: la U se interpreta como T, por lo que los resultados se muestran con letras de ADN.
¿Qué código genético se utiliza?
El código estándar (tabla 1 del NCBI); los genes mitocondriales y algunos genes microbianos utilizan códigos ligeramente diferentes.
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